Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL40Q9NQ50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL40Q9NQ50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL40Q9NQ50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms