Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMMDC1Q9NPL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms