Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSU72Q9NP77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSU72Q9NP77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SSU72Q9NP77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms