Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm2bQ9JME9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm2bQ9JME9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm2bQ9JME9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm2bQ9JME9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms