Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PnkpQ9JLV6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PnkpQ9JLV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnkpQ9JLV6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnkpQ9JLV6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PnkpQ9JLV6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms