Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1aQ9JLR9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Higd1aQ9JLR9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.5 ms