Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dclk1Q9JLM8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclk1Q9JLM8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dclk1Q9JLM8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dclk1Q9JLM8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclk1Q9JLM8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dclk1Q9JLM8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk1Q9JLM8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms