Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col5a3Q9JLI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col5a3Q9JLI2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col5a3Q9JLI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Col5a3Q9JLI2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col5a3Q9JLI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395.9 ms