Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AtrQ9JKK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
AtrQ9JKK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtrQ9JKK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AtrQ9JKK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms