Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3m1Q9JKC8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3m1Q9JKC8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3m1Q9JKC8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms