Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnbip1Q9JJN6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms