Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad9Q9JIW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad9Q9JIW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad9Q9JIW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad9Q9JIW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad9Q9JIW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms