Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1fQ9JIS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna1fQ9JIS7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1fQ9JIS7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1fQ9JIS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms