Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sphk2Q9JIA7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sphk2Q9JIA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sphk2Q9JIA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sphk2Q9JIA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms