Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cxcl11Q9JHH5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cxcl11Q9JHH5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cxcl11Q9JHH5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cxcl11Q9JHH5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cxcl11Q9JHH5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cxcl11Q9JHH5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms