Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timp4Q9JHB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timp4Q9JHB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Timp4Q9JHB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Timp4Q9JHB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms