Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549Q9HCM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549Q9HCM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIAA1549Q9HCM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms