Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARX1Q9HBU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BARX1Q9HBU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BARX1Q9HBU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BARX1Q9HBU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms