Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB96

FANCE, Fanconi anemia group E protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCEQ9HB96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCEQ9HB96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCEQ9HB96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCEQ9HB96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCEQ9HB96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCEQ9HB96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCEQ9HB96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms