Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTN4Q9HB63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NTN4Q9HB63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTN4Q9HB63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms