Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF2Q9HAK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF2Q9HAK2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF2Q9HAK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF2Q9HAK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EBF2Q9HAK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms