Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W4

PLEKHF2, Pleckstrin homology domain-containing family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF2Q9H8W4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLEKHF2Q9H8W4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLEKHF2Q9H8W4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLEKHF2Q9H8W4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHF2Q9H8W4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF2Q9H8W4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.4 ms