Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMYD3Q9H7B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD3Q9H7B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD3Q9H7B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD3Q9H7B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms