Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCNX3Q9H6A9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNX3Q9H6A9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX3Q9H6A9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX3Q9H6A9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms