Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOC1Q9H4F8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOC1Q9H4F8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOC1Q9H4F8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOC1Q9H4F8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOC1Q9H4F8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOC1Q9H4F8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOC1Q9H4F8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOC1Q9H4F8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOC1Q9H4F8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms