Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms