Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCX3BQ9H321 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCX3BQ9H321 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCX3BQ9H321 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCX3BQ9H321 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms