Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA6AQ9H2E6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA6AQ9H2E6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA6AQ9H2E6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms