Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSRNP2Q9H175 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP2Q9H175 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSRNP2Q9H175 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP2Q9H175 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSRNP2Q9H175 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP2Q9H175 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP2Q9H175 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSRNP2Q9H175 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSRNP2Q9H175 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRNP2Q9H175 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms