Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC8Q9H0W5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC8Q9H0W5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC8Q9H0W5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC8Q9H0W5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC8Q9H0W5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC8Q9H0W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms