Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC113Q9H0I3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC113Q9H0I3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC113Q9H0I3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC113Q9H0I3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC113Q9H0I3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms