Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLIRPQ9GZT3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLIRPQ9GZT3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms