Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb3Q9ERD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb3Q9ERD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb3Q9ERD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb3Q9ERD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb3Q9ERD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb3Q9ERD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms