Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tfip11Q9ERA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tfip11Q9ERA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfip11Q9ERA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfip11Q9ERA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms