Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dap3Q9ER88 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dap3Q9ER88 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dap3Q9ER88 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms