Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scn4aQ9ER60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scn4aQ9ER60 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Scn4aQ9ER60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scn4aQ9ER60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Scn4aQ9ER60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scn4aQ9ER60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Scn4aQ9ER60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scn4aQ9ER60 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Scn4aQ9ER60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Scn4aQ9ER60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms