Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a3bpQ9EQG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a3bpQ9EQG9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a3bpQ9EQG9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col4a3bpQ9EQG9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms