Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1lQ9EQ00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1lQ9EQ00 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1lQ9EQ00 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ropn1lQ9EQ00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms