Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Upf1Q9EPU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Upf1Q9EPU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf1Q9EPU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Upf1Q9EPU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Upf1Q9EPU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Upf1Q9EPU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms