Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufs3Q9DCT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufs3Q9DCT2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufs3Q9DCT2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufs3Q9DCT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufs3Q9DCT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms