Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf6Q9DBU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rnf6Q9DBU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf6Q9DBU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf6Q9DBU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf6Q9DBU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms