Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SrpraQ9DBG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SrpraQ9DBG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrpraQ9DBG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrpraQ9DBG7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms