Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fundc1Q9DB70 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fundc1Q9DB70 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fundc1Q9DB70 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fundc1Q9DB70 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fundc1Q9DB70 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms