Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med27Q9DB40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med27Q9DB40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med27Q9DB40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Med27Q9DB40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med27Q9DB40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med27Q9DB40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms