Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAM1

Lrrc34, Leucine-rich repeat-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc34Q9DAM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc34Q9DAM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc34Q9DAM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc34Q9DAM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc34Q9DAM1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc34Q9DAM1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc34Q9DAM1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms