Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim23Q9DAL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim23Q9DAL0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim23Q9DAL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms