Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scp2d1Q9DAH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scp2d1Q9DAH1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scp2d1Q9DAH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms