Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf7Q9DAG9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf7Q9DAG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf7Q9DAG9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf7Q9DAG9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms