Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9D9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9D9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9D9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D9D9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9D9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9D9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9D9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9D9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9D9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9D9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9D9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D9D9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9D9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D9D9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms