Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot8Q9D8X5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot8Q9D8X5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot8Q9D8X5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot8Q9D8X5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot8Q9D8X5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms